課程資訊
課程名稱
作物功能基因體學導論
Introductory Crop Functional Genomics 
開課學期
105-1 
授課對象
生物資源暨農學院  農藝學系  
授課教師
常玉強 
課號
Agron5034 
課程識別碼
621 U6220 
班次
 
學分
全/半年
半年 
必/選修
選修 
上課時間
星期三3,4(10:20~12:10) 
上課地點
農藝108 
備註
限學士班四年級以上
總人數上限:30人 
Ceiba 課程網頁
http://ceiba.ntu.edu.tw/1051Agron5034_funct 
課程簡介影片
 
核心能力關聯
核心能力與課程規劃關聯圖
課程大綱
為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
課程概述

基因體學整合了遺傳學、生物化學、分子生物學、細胞生物學及其他相關科學而成之新興科學。近來,許多重要物種之基因體已(將)完成定序工作,如何在龐大的DNA資訊中鑑定(並選殖)出有功能之基因是未來重要的工作,此即功能基因體學。授課老師自編一份講義,針對生物相關領域的學生(曾修過遺傳學或分子生物學)作一入門之介紹。課程主要分兩部分:第一章至第九章針對植物單一基因之各種研究,第十章至第十三章則擴展至基因與基因之間之相互作用之各種研究。包括介紹如何研究有興趣性狀所負責之基因(序列),以及marker之應用,再配合電腦網路之資源之介紹,傳達網路資源對基因體學研究之重要性。其後介紹新興之方法—Gene Tagging技術,及其所衍生之新方法如:Gene trapping、Activation tagging。並介紹這些技術在順向/逆向遺傳學上之應用。而『Mutants screening』則蒐集十年來所有相關文獻約百篇文獻之內容。最後介紹獲得基因(之序列)後,如何印證,以及如何利用非基改生物技術CRISPR修改或創造新功能基因。第十章至第十三章則針對了解個別基因後,尚需了解基因與基因之間相互調控,才能支撐龐大的生命現象。分別以性狀、mRNA、蛋白質及代謝化合物為平台研究基因間之相互關係。最後第十四章比較動物相關之基因體學研究作為結束。由於授課內容常牽涉性狀之描述,因此講義以彩色power point圖檔型態表達。其他課程資訊可在本校網頁查詢。 

課程目標
介紹基因之開發及研究,本課程列入農藝系「作物基因體專攻領域」。 
課程要求
大四以上同學,強烈建議先修分子生物學,至少先修過遺傳學 
預期每週課後學習時數
 
Office Hours
 
指定閱讀
待補 
參考書目
自定教材 
評量方式
(僅供參考)
 
No.
項目
百分比
說明
1. 
期中、末考 
70% 
 
2. 
期末報告 
30% 
 
 
課程進度
週次
日期
單元主題
第1週
09/14  Chap 1. Introduction: genome and genome size 
第2週
09/21  Chap 2. How to clone a plant/crop gene 
第3週
09/28  Chap 3a. Functional genomics & genome sequencing projects 
第4週
10/05  Chap 3b. Functional genomics & genome sequencing projects
影片網址:
https://www.space.ntu.edu.tw/navigate/s/5147076F112F4F7890DB51DACB7E11D4QQY 
第5週
10/12  Chap 4. Forward and reverse genetic approaches to gene function 
第6週
10/19  Chap 5. Gene tagging and trapping 
第7週
10/26  Chap 6. PCR, inverse PCR and TAIL PCR 
第8週
11/02  Chap 7a. Mutant screening 
第9週
11/09  Chap 7b. Mutant screening 
第10週
11/16  Chap 8. How to identify a cloned gene: complementation, targeting 
第11週
11/23  Quiz 
第12週
11/30  考題檢討 
第13週
12/07  Chap 9. Functional genomics study in animal system 
第14週
12/14  Chap 10. Phenomics: phenotypic profiling of mutant collections 
第15週
12/21  Chap 11. Transcriptomics: gene expression analysis by mRNA profiling 
第16週
12/28  Chap 12. Proteomics: analyzing the plant proteome  
第17週
01/04  Chap 13. Metabolomics: profiling the composition of metabolites 
第18週
01/11  Animal gene tagging report